A Segurança Institucional é composta por um grupo de Agentes da Guarda Universitária, subordinada à Superintendência de Prevenção e Proteção Universitária da Universidade de São Paulo. Criada em 2001, diante da necessidade constante de segurança no órgão central que gere a universidade, a Segurança Institucional atua em diversas frentes de trabalho que compreendem desde o atendimento ao usuário até o planejamento (em conjunto com o Cerimonial do Gabinete do Reitor) para recepção de autoridades brasileiras e estrangeiras, participação em eventos internos e externos, solenidades originárias do Poder Público, acompanhamentos aos membros que compõe a direção da Universidade, supervisão e apoio às equipes de segurança terceirizada que prestam serviço na Reitoria e Administração Central, proteção ao patrimônio público, desenvolvimento de procedimentos operacionais pertinentes à segurança da reitoria a serem adotados nos momentos de urgência e necessidade.
O setor subsidia as necessidades relacionadas à segurança do Gabinete do Reitor e demais gabinetes da Reitoria, atuando preventivamente no que diz respeito às potenciais áreas inseguras, minimizando os riscos e trazendo por consequência a sensação de segurança aos funcionários, discentes e docentes que atuam ou visitam as dependências da Reitoria.
As atividades desempenhadas pelos Agentes são desenvolvidas dentro das diretrizes de uma política que visa o aprimoramento das relações profissionais, harmonia nos relacionamentos interpessoais com vistas à excelência no atendimento, fatores esses tão necessários na obtenção de resultados positivos.
A Segurança Institucional atua buscando a sinergia com as demais áreas que indiretamente refletem no cenário da segurança dos prédios da Reitoria e da administração central.